در همه‌ی سازمان‌ها و شرکتها محاسبه و پرداخت حقوق و دستمزد کارکنان از مهم ترین محاسبات بخش مالی می باشد. این عملیات  جزو وقت گیر ترین محاسبات بخشهای مالی و اداری به شمار می‌آید.

در نرم افزار حسابداری حقوق و دستمزد هلو عملیاتی مانند اطلاعات فردی. هر یک از کارکنان و احکام پرسنلی آنها به صورت فعالیتهای اصلی و پایه ای محسوب می شود. تهیه لیست های حقوق ، بیمه و مالیات از دیگر موارد استفاده شده در  نرم افزار حسابداری حقوق و دستمزد هلو می باشد. از امکانات عمومی نرم افزار می توان به معرفی مشخصه های مزایا. و کسورات ، گزارش وام و مساعده پرسنل و مرخصی و غیبت آنها اشاره کرد.

اگر ورود اطلاعات پایه ای پرسنل، به طور دقیق یکبار انجام گردد، در دوره های مختلف قابل استفاده بوده و در صورت نیاز قابل اصلاح می باشد. در این نرم افزار حسابداری، همزمان با تغییرات قوانین مالیاتی و قانون کار و تامین اجتماعی، اصلاحات مورد نیاز در نرم افزار مالی انجام می شود. این نرم افزار مالی به صورت مستمر به روز رسانی می شود. در آن امکان تهیه فایل بیمه و مالیات حقوق طبق آخرین تغییرات وجود دارد.

یکی از مشکلاتی که حسابداری حقوق و دستمزد دارد، ثبت سند حسابداری است. این کار اگر به صورت دستی انجام شود زمان زیادی برای آن صرف می‌شود و اشتباهات زیادی دارد. همچنین یکی دیگر از قابلیت‌های این نرم افزارها ثبت عیدی، پاداش و بازخرید طبق کارکرد پرسنل است.بر خلاف نظر بسیاری از افراد که تصور می‌کنند محاسبات حقوق و دستمزد کار آسانی است و به‌وسیله نرم‌افزار اکسل به راحتی انجام می‌شود، این کار پیچیدگی‌های زیادی دارد و سهل‌انگاری در انجام امور آن می‌تواند مشکلات زیادی را برای سازمان ایجاد کند.